Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms