Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Upk1aQ9D132 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Upk1aQ9D132 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Upk1aQ9D132 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Upk1aQ9D132 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Upk1aQ9D132 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Upk1aQ9D132 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Upk1aQ9D132 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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