Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift27Q9D0P8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms