Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spc24Q9D083 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spc24Q9D083 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms