Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms