Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms