Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms