Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms