Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
3110001I22RikQ9CZ70 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms