Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim13Q9CYB0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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