Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kdm8Q9CXT6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kdm8Q9CXT6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kdm8Q9CXT6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kdm8Q9CXT6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kdm8Q9CXT6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kdm8Q9CXT6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm8Q9CXT6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms