Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Sgo1Q9CXH7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sgo1Q9CXH7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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