Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Xrcc3Q9CXE6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Xrcc3Q9CXE6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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