Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Wdr55Q9CX97 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms