Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms