Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Xrcc2Q9CX47 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Xrcc2Q9CX47 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Xrcc2Q9CX47 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Xrcc2Q9CX47 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Xrcc2Q9CX47 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Xrcc2Q9CX47 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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