Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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