Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms