Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms