Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms