Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms