Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms