Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms