Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW2

Arl8b, ADP-ribosylation factor-like protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl8bQ9CQW2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl8bQ9CQW2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms