Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Commd4Q9CQ02 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms