Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmc1Q9CPZ8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc1Q9CPZ8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms