Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms