Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Bco2Q99NF1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Bco2Q99NF1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Bco2Q99NF1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Bco2Q99NF1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Bco2Q99NF1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Bco2Q99NF1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Bco2Q99NF1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Bco2Q99NF1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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