Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Mrpl3Q99N95 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl3Q99N95 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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