Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms