Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms