Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms