Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms