Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms