Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms