Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms