Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdxdc1Q99K01 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdxdc1Q99K01 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms