Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TirapQ99JY1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TirapQ99JY1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms