Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms