Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms