Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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