Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cldn16Q925N4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms