Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms