Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms