Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf3Q922U1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms