Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Afg3l1Q920A7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Afg3l1Q920A7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Afg3l1Q920A7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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