Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin3bQ91ZU9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin3bQ91ZU9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms