Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q91WD4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q91WD4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q91WD4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q91WD4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q91WD4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q91WD4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q91WD4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q91WD4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q91WD4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms