Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms