Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd3Q91W18 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd3Q91W18 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd3Q91W18 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd3Q91W18 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd3Q91W18 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd3Q91W18 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd3Q91W18 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd3Q91W18 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms